南京目前有南京站、南京西站、南京南站3个客运站，南京北站1个货运站，南京东站1个编组站。
南京站
途径交通：1路、13路、17路、22路、33路、36路、44路、56路、59路、64路、 66路、69路、71路、130路、159路、游1路、318路、玉六线、以及地铁一号线。
南京站前往各景点：
1）地铁一号线，可以通达市中心新街口、湖南路、玄武湖、鼓楼，夫子庙，雨花台，奥体公园；公交游1路，可通达总统府、钟山风景区；
2）公交1路，可通达夫子庙；
3）公交13路，可到莫愁湖；
4）公交33路，可通达中华门、雨花台；
5）公交44路，可通达鸡鸣寺、总统府、夫子庙。
6）公交南汤线，可通达各温泉。
7）机场班车，可通达南京禄口国际机场。
旅人提示：游1路、1路、13路、33路等在南京火车站西公交站台上车，44路、机场班车在公交站台上车。
南京西站
从南京始发的列车大部分由南京西站开出。
途径交通：10路、16路、18路、21路、39路、53路、149路、307路、游4路。
南京西站前往各景点：
1） 公交16路，通达雨花台、夫子庙、中华门；
2） 公交18路，通达新街口；
3） 公交307路，通达莫愁湖；
4）游4路，通达雨花台、中华门、莫愁湖、纪念馆。
南京南站
途经南京的列车大多数停靠南京站。南京南站（中华门站）有始发安徽芜湖、铜陵的短途旅客列车，宁铜线上的普快列车也多停靠该站。
途径交通：2路、16路、49路、110路、116路、126路、东奥线、及地铁一号线（中华门站）。
南京南站前往各景点：
1） 公交49路，通达雨花台、中华门、夫子庙；
2） 公交16路，通达雨花台、夫子庙、新街口、鼓楼、南京西站；
3） 公交2路，通达长途东站、鸡鸣寺、大行宫、淮海路、中华门和雨花台；
4）地铁一号线，可以通达市中心新街口、湖南路、玄武湖、鼓楼，夫子庙，雨花台，奥体公园。
南京北站
南京北站原名浦口站，位于南京市浦口区临江路1号，朱自清写下散文名篇《背影》的地方。现在是货站，已经没有客运业务，将来准备改造成影视基地，民国风格。
动车组
沪宁之间每日开行25对动车列车组，一般2小时15分钟左右从南京到达上海，中途有停站，二等座票价93元。
从南京到上海的动车组列车最快仅需1小时57分，是北京—上海的D31/32、D305/306次列车，在南京站停靠，沪宁之间不停。青岛—上海的D75/78次列车，郑州—上海的D85/84次列车也停靠南京站，2小时5分钟左右从南京到达上海。
旅人提示：1）虽然沪宁间动车组车次比较多，但节假日和周末要随到随走还是比较困难的，所以最好提前1天购票。
2）南京市区的主要车票预售点有：鼓楼售票处（中山路366号鼓楼邮政大厦一楼营业厅内），建达大厦（虹桥与山西路之间），西康路33号（省委招待所礼堂内），蓝色快车（进香河路9号102室），洪武路283号（省中旅航服公司内），大厂区新华路527号（扬子石化票务中心内）。
沪宁高铁
沪宁高铁2010年7月1日运营通车，从上海直达南京，全程310公里，最快75分钟从上海到南京。从上海出发，途经昆山、苏州、无锡、常州、镇江，最后到达南京，实现长三角地区“同城旅游”。沪宁城际专线与京沪铁路沪宁段部分共线行驶；D车仍维持原价，但沪宁线车次大幅减少，且多为越宁过路车；G车沪宁全程：二等座146元，一等座233元；沪常二等：80元；宁常二等：66元。
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